Se crió en Manhattan y se licenció con especialidad doble en Estudios cinematográficos y Producción cinematográfica y televisiva por la Escuela de las Artes Tisch de la Universidad de Nueva York. Ha escrito y dirigido el cortometraje A Dog Race in Alaska (1993), protagonizado por Sam Waterston y James Waterston; a lo que siguió el documental corto Hired Hands (1994).
Casado con la actriz Julianne Moore, un año después del nacimiento de su hija, en 2002, Freundlich se casó con Moore. Viven en Manhattan con sus hijos, Caleb y Liv.