Los padres de Tobey tenían 18 y 20 años cuando él nació.
Su padre, Vincent, era cocinero y su madre, Wendy, secretaria.
Ellos se separaron dos años después de su nacimiento. Esto hizo que durante su niñez tuviera que viajar y vivir en varios sitios como California, Oregón y Washington.
Abandonó el colegio en noveno grado con el propósito de buscar su gran oportunidad como actor. Hizo varios comerciales y pequeños papeles en programas de TV antes de conseguir un papel en la serie de Fox Great Scott.
Ese personaje duró 9 semanas antes de que el show fuera cancelado. Evita las drogas y el alcohol, aunque sí es conocido por ser un joven que disfruta con sus amigos como Leonardo DiCaprio. Él es vegetariano y estudia yoga.
En el 2002 se compró una mansión en Beverly Hills por 3.5 millones de dólares con sus ganancias adquiridas por Spider-Man.